Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vti1bO88384 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vti1bO88384 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms