Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stra6O70491 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stra6O70491 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stra6O70491 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stra6O70491 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra6O70491 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stra6O70491 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra6O70491 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Stra6O70491 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stra6O70491 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stra6O70491 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stra6O70491 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stra6O70491 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stra6O70491 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Stra6O70491 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stra6O70491 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stra6O70491 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stra6O70491 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stra6O70491 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stra6O70491 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stra6O70491 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stra6O70491 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stra6O70491 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stra6O70491 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Stra6O70491 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stra6O70491 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stra6O70491 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stra6O70491 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stra6O70491 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stra6O70491 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stra6O70491 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms