Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb5O70309 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Itgb5O70309 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb5O70309 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms