Protein–RNA interactions for Protein: O70228

Atp9a, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9aO70228 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp9aO70228 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp9aO70228 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp9aO70228 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms