Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Supt5hO55201 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Supt5hO55201 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Supt5hO55201 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms