Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dsg2O55111 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dsg2O55111 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms