Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syngr1O55100 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngr1O55100 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms