Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Copb2O55029 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Copb2O55029 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Copb2O55029 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Copb2O55029 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Copb2O55029 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Copb2O55029 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Copb2O55029 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Copb2O55029 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Copb2O55029 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Copb2O55029 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms