Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnajb6O54946 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnajb6O54946 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnajb6O54946 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnajb6O54946 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnajb6O54946 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnajb6O54946 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnajb6O54946 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnajb6O54946 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dnajb6O54946 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dnajb6O54946 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dnajb6O54946 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnajb6O54946 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms