Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FxnO35943 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FxnO35943 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FxnO35943 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FxnO35943 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FxnO35943 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FxnO35943 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FxnO35943 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FxnO35943 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FxnO35943 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FxnO35943 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FxnO35943 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FxnO35943 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FxnO35943 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FxnO35943 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FxnO35943 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FxnO35943 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FxnO35943 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FxnO35943 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FxnO35943 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FxnO35943 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FxnO35943 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FxnO35943 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FxnO35943 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FxnO35943 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FxnO35943 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FxnO35943 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FxnO35943 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FxnO35943 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FxnO35943 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FxnO35943 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FxnO35943 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FxnO35943 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FxnO35943 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FxnO35943 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FxnO35943 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FxnO35943 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FxnO35943 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FxnO35943 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FxnO35943 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FxnO35943 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FxnO35943 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FxnO35943 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FxnO35943 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FxnO35943 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FxnO35943 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FxnO35943 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FxnO35943 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FxnO35943 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FxnO35943 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FxnO35943 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FxnO35943 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FxnO35943 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FxnO35943 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FxnO35943 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FxnO35943 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FxnO35943 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FxnO35943 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FxnO35943 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FxnO35943 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FxnO35943 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FxnO35943 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FxnO35943 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FxnO35943 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FxnO35943 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FxnO35943 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FxnO35943 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FxnO35943 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FxnO35943 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FxnO35943 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FxnO35943 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FxnO35943 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FxnO35943 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FxnO35943 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FxnO35943 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FxnO35943 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FxnO35943 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FxnO35943 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FxnO35943 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FxnO35943 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FxnO35943 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FxnO35943 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FxnO35943 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FxnO35943 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FxnO35943 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FxnO35943 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FxnO35943 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FxnO35943 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FxnO35943 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FxnO35943 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FxnO35943 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FxnO35943 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FxnO35943 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FxnO35943 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FxnO35943 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FxnO35943 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FxnO35943 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FxnO35943 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FxnO35943 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FxnO35943 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms