Protein–RNA interactions for Protein: O35716

Socs1, Suppressor of cytokine signaling 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs1O35716 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Socs1O35716 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Socs1O35716 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Socs1O35716 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Socs1O35716 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Socs1O35716 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Socs1O35716 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Socs1O35716 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Socs1O35716 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms