Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfrsf18O35714 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf18O35714 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf18O35714 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms