Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ppfibp2O35711 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ppfibp2O35711 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppfibp2O35711 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms