Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clk2O35491 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Clk2O35491 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clk2O35491 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clk2O35491 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clk2O35491 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clk2O35491 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clk2O35491 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clk2O35491 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Clk2O35491 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clk2O35491 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms