Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Pkd2O35245 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pkd2O35245 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms