Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad6O35182 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad6O35182 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smad6O35182 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Smad6O35182 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad6O35182 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smad6O35182 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad6O35182 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad6O35182 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smad6O35182 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smad6O35182 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smad6O35182 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smad6O35182 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smad6O35182 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Smad6O35182 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smad6O35182 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smad6O35182 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smad6O35182 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad6O35182 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad6O35182 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad6O35182 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad6O35182 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad6O35182 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad6O35182 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad6O35182 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad6O35182 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smad6O35182 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad6O35182 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad6O35182 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smad6O35182 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms