Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcns1O35173 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms