Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrc23O35125 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc23O35125 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms