Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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H2-Q1O19441 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-Q1O19441 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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H2-Q1O19441 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
H2-Q1O19441 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
H2-Q1O19441 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
H2-Q1O19441 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
H2-Q1O19441 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Q1O19441 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Q1O19441 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Q1O19441 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Q1O19441 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Q1O19441 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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H2-Q1O19441 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Q1O19441 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Q1O19441 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Q1O19441 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Q1O19441 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Q1O19441 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Q1O19441 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
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H2-Q1O19441 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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H2-Q1O19441 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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H2-Q1O19441 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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H2-Q1O19441 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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H2-Q1O19441 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Q1O19441 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Q1O19441 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Q1O19441 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Q1O19441 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Q1O19441 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Q1O19441 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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H2-Q1O19441 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Q1O19441 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Q1O19441 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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H2-Q1O19441 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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H2-Q1O19441 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Q1O19441 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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H2-Q1O19441 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Q1O19441 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Q1O19441 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Q1O19441 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Q1O19441 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Q1O19441 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Q1O19441 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Q1O19441 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Q1O19441 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Q1O19441 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Q1O19441 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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H2-Q1O19441 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Q1O19441 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Q1O19441 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Q1O19441 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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