Protein–RNA interactions for Protein: O08576

Rundc3a, RUN domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3aO08576 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc3aO08576 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc3aO08576 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rundc3aO08576 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc3aO08576 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc3aO08576 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc3aO08576 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc3aO08576 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc3aO08576 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc3aO08576 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc3aO08576 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc3aO08576 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc3aO08576 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc3aO08576 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc3aO08576 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc3aO08576 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rundc3aO08576 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc3aO08576 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc3aO08576 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc3aO08576 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc3aO08576 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc3aO08576 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rundc3aO08576 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rundc3aO08576 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rundc3aO08576 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rundc3aO08576 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rundc3aO08576 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rundc3aO08576 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rundc3aO08576 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rundc3aO08576 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rundc3aO08576 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rundc3aO08576 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rundc3aO08576 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rundc3aO08576 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rundc3aO08576 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rundc3aO08576 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rundc3aO08576 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms