Protein–RNA interactions for Protein: O08529

Capn2, Calpain-2 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn2O08529 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn2O08529 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Capn2O08529 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn2O08529 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn2O08529 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn2O08529 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Capn2O08529 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn2O08529 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn2O08529 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn2O08529 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn2O08529 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn2O08529 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn2O08529 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn2O08529 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn2O08529 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn2O08529 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn2O08529 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn2O08529 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn2O08529 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn2O08529 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn2O08529 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn2O08529 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn2O08529 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn2O08529 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn2O08529 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn2O08529 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn2O08529 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn2O08529 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn2O08529 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn2O08529 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn2O08529 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms