Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8050L7N2E3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8050L7N2E3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms