Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm20878L7N244 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20878L7N244 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm20878L7N244 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20878L7N244 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20878L7N244 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20878L7N244 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20878L7N244 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20878L7N244 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20878L7N244 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20878L7N244 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20878L7N244 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20878L7N244 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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