Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U5

Vmn2r78, Vomeronasal 2, receptor 78, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r78K7N6U5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r78K7N6U5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r78K7N6U5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r78K7N6U5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r78K7N6U5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r78K7N6U5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r78K7N6U5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r78K7N6U5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r78K7N6U5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r78K7N6U5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r78K7N6U5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r78K7N6U5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r78K7N6U5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r78K7N6U5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r78K7N6U5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r78K7N6U5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r78K7N6U5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r78K7N6U5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r78K7N6U5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r78K7N6U5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r78K7N6U5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r78K7N6U5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r78K7N6U5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r78K7N6U5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r78K7N6U5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r78K7N6U5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r78K7N6U5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r78K7N6U5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r78K7N6U5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r78K7N6U5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r78K7N6U5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r78K7N6U5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r78K7N6U5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r78K7N6U5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r78K7N6U5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r78K7N6U5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r78K7N6U5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r78K7N6U5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r78K7N6U5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r78K7N6U5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r78K7N6U5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r78K7N6U5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms