Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm2056J3QQ02 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms