Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX0

5730507C01Rik, RIKEN cDNA 5730507C01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730507C01RikJ3QPX0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
5730507C01RikJ3QPX0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms