Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm2035J3QP87 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms