Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5294J3QP53 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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