Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Gm20918J3QN17 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20918J3QN17 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20918J3QN17 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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