Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3415J3QMS8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3415J3QMS8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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