Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28051J3QMA2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms