Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm6594J3QM43 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm6594J3QM43 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6594J3QM43 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6594J3QM43 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6594J3QM43 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6594J3QM43 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6594J3QM43 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6594J3QM43 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6594J3QM43 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6594J3QM43 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6594J3QM43 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm6594J3QM43 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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