Protein–RNA interactions for Protein: J3QJZ1

Gm21969, Predicted gene 21969, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21969J3QJZ1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm21969J3QJZ1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm21969J3QJZ1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm21969J3QJZ1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms