Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU2

Gm21820, Predicted gene, 21820, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21820J3KMU2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21820J3KMU2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm21820J3KMU2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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