Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm29394H3BIW7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm29394H3BIW7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm29394H3BIW7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm29394H3BIW7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm29394H3BIW7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm29394H3BIW7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms