Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf4bG5E8Z2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Taf4bG5E8Z2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Taf4bG5E8Z2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms