Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx1-1G3UXB3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx1-1G3UXB3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx1-1G3UXB3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms