Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.3■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.29■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.29■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.27■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XntrpcF8VQM8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
XntrpcF8VQM8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XntrpcF8VQM8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XntrpcF8VQM8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XntrpcF8VQM8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XntrpcF8VQM8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XntrpcF8VQM8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XntrpcF8VQM8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
XntrpcF8VQM8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XntrpcF8VQM8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XntrpcF8VQM8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XntrpcF8VQM8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XntrpcF8VQM8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XntrpcF8VQM8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XntrpcF8VQM8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XntrpcF8VQM8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XntrpcF8VQM8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XntrpcF8VQM8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128 ms