Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccl26F8VQM2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccl26F8VQM2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccl26F8VQM2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccl26F8VQM2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccl26F8VQM2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccl26F8VQM2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccl26F8VQM2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccl26F8VQM2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccl26F8VQM2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccl26F8VQM2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccl26F8VQM2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccl26F8VQM2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccl26F8VQM2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccl26F8VQM2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccl26F8VQM2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccl26F8VQM2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccl26F8VQM2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms