Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Farp1F8VPU2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Farp1F8VPU2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Farp1F8VPU2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.9 ms