Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ttc37F8VPK0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ttc37F8VPK0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ttc37F8VPK0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ttc37F8VPK0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ttc37F8VPK0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ttc37F8VPK0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ttc37F8VPK0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ttc37F8VPK0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ttc37F8VPK0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ttc37F8VPK0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ttc37F8VPK0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ttc37F8VPK0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ttc37F8VPK0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ttc37F8VPK0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ttc37F8VPK0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ttc37F8VPK0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ttc37F8VPK0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ttc37F8VPK0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ttc37F8VPK0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ttc37F8VPK0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Ttc37F8VPK0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ttc37F8VPK0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ttc37F8VPK0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ttc37F8VPK0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ttc37F8VPK0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ttc37F8VPK0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ttc37F8VPK0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ttc37F8VPK0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ttc37F8VPK0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms