Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28038F7BCN9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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