Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
D430041D05RikF6ZGR6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
D430041D05RikF6ZGR6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
D430041D05RikF6ZGR6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms