Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm10378F6XQQ1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm10378F6XQQ1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm10378F6XQQ1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm10378F6XQQ1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm10378F6XQQ1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm10378F6XQQ1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm10378F6XQQ1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm10378F6XQQ1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm10378F6XQQ1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm10378F6XQQ1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm10378F6XQQ1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm10378F6XQQ1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm10378F6XQQ1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm10378F6XQQ1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm10378F6XQQ1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm10378F6XQQ1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm10378F6XQQ1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm10378F6XQQ1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm10378F6XQQ1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm10378F6XQQ1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm10378F6XQQ1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm10378F6XQQ1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm10378F6XQQ1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm10378F6XQQ1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm10378F6XQQ1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm10378F6XQQ1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm10378F6XQQ1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm10378F6XQQ1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm10378F6XQQ1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm10378F6XQQ1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm10378F6XQQ1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm10378F6XQQ1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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