Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
Crocc2F6XLV1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Crocc2F6XLV1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Crocc2F6XLV1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Crocc2F6XLV1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Crocc2F6XLV1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Crocc2F6XLV1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Crocc2F6XLV1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Crocc2F6XLV1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Crocc2F6XLV1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Crocc2F6XLV1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Crocc2F6XLV1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Crocc2F6XLV1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Crocc2F6XLV1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Crocc2F6XLV1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Crocc2F6XLV1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Crocc2F6XLV1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Crocc2F6XLV1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Crocc2F6XLV1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Crocc2F6XLV1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Crocc2F6XLV1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Crocc2F6XLV1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Crocc2F6XLV1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Crocc2F6XLV1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Crocc2F6XLV1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Crocc2F6XLV1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Crocc2F6XLV1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Crocc2F6XLV1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Crocc2F6XLV1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Crocc2F6XLV1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Crocc2F6XLV1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Crocc2F6XLV1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Crocc2F6XLV1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms