Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm28305F6U473 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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