Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf212F6TQD1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms