Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc7bE9Q9Y3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Ccdc7bE9Q9Y3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Ccdc7bE9Q9Y3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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