Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc74aE9Q9U8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms