Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
R3hdm1E9Q9Q2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
R3hdm1E9Q9Q2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
R3hdm1E9Q9Q2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms